全基因組測序

樣本類(lèi)型

樣本要求

保存及運輸條件

說(shuō)明內容

新鮮組織

1.新鮮組織標本（腫瘤樣本在術(shù)后 30分鐘內取得）≥50mg（黃豆粒大?。?，-80℃直接長(cháng)期凍存，-20℃可保存2-3個(gè)月。

2.穿刺樣本：腫瘤組織長(cháng)度≥1 cm，2-3條；所有新鮮組織標本要求未壞死腫瘤組織比例在70%以上；必須首先進(jìn)行常規病理診斷，可于-80℃直接長(cháng)期凍存，-20℃可保存2-3個(gè)月 。

干冰運輸

白片/蠟卷

1.切片厚度3-5 μm，5-10張（組織≥1×1 cm² ）或10-20張（組織＜1×1 cm²）切片；白片置于切片盒中。

2.蠟卷：直接置于1.5 mL無(wú)菌離心管中。

常溫保存和運輸

蠟卷應保證組織含量充足；盡量送檢一年以?xún)鹊氖灅吮尽?/p>

外周血（DNA）

1.EDTA抗凝管采集（紫色）：4-5 mL靜脈血，4℃保存，4-6小時(shí)內分離血漿，分離后血漿不少于2 mL。

2.Streck管采集樣本：4-5 mL靜脈血，常溫可存儲72 h，分離后血漿不少于2 mL。

1.EDTA 抗凝管采集的血液，經(jīng)分離血漿后，48 h內送達，可使用足量冰袋，用泡沫箱運輸；超過(guò)48 h，使用干冰運輸。2.Streck管采集的血液，72 h內送達，常溫運輸，注意避免劇烈震蕩。

收樣后立刻提取或-80℃暫存。

外周血（cfDNA）

1.EDTA抗凝管采集（紫色）：4-5 mL靜脈血；4℃保存，4-6小時(shí)內分離血漿，分離后血漿不少于原體積一半；分離后的血漿在-20℃冰箱最多可保存一周。

2.Streck管：4-5 mL靜脈血，分離后血漿不少于原體積一半，常溫可存儲72 h。

1.EDTA抗凝管采集的血液，經(jīng)分離血漿后，48 h內送達，可使用足量冰袋，用泡沫箱運輸；超過(guò)48 h，使用干冰運輸。2.Streck管采集的血液，72 h內送達，常溫運輸，注意避免劇烈震蕩。

收樣后立刻提取。

gDNA

基因組DNA用TE溶解；總量≥500 ng （采用HiSeq X平臺）或≥2 μg （采用HiSeq2000/2500平臺）；純度OD_260/280在1.8-2.0之間；濃度≥50 ng/μL。DNA完整無(wú)降解，無(wú) RNA、蛋白質(zhì)等污染。

使用 1.5 mL或2 mL離心管盛放，用parafilm封口膜密封，然后將樣本管置于保護用的50 mL離心管或其他類(lèi)似容器里，并旋緊蓋子。使用足量冰袋，用泡沫箱運輸。

某些種類(lèi)植物DNA 樣本需要專(zhuān)門(mén)去除多糖。